Et komplet animalsk fedtraffineringssystems stabile drift og ultimative økonomiske effektivitet afhænger ikke kun af hovedreaktions- og separationsudstyret, men også i høj grad af en række hjælpesystemer. Disse systemer afspejler ofte udstyrsproducentens dybdegående forståelse af hele produktionsprocessen.
Først er det termiske energisystem. Et effektivt varmevekslernetværksdesign kan genvinde spildvarme fra dampkondensatet, der udledes fra kogetankene, samt fra høj-temperaturfedt og slam til forvarmning af råmaterialer eller procesvand. Dette reducerer dampforbruget betydeligt, en afgørende indikator for udstyrets energieffektivitet. For det andet er lugtkontrolsystemet. Dyrefoder producerer flygtige lugtstoffer under madlavningen. I modsætning til helt åbne eller simple udstødningssystemer opsamler og behandler lukkede systemer udstyret med kondensatorer og biologisk deodorisering eller kemiske skrubbeanordninger effektivt lugte og opfylder de strenge miljøkrav fra moderne fabrikker. For det tredje er det automatiserede kontrolsystem. Brug af en PLC (Programmable Logic Controller) til programmæssig styring af nøgleparametre såsom temperatur, tryk, omrøringshastighed og fodrings-/aflæsningstider reducerer usikkerheden ved menneskelig drift, sikrer stabiliteten af produktkvaliteten på tværs af forskellige batcher og reducerer også arbejdsintensiteten. Graden af integration og ydeevne af disse hjælpesystemer er nøgleindikatorer, der adskiller simple behandlingsenheder fra industrialiserede komplette udstyrssæt.
